第二集：应天风云起 由于海瑞在淳安县的出色表现，他的名声渐渐传到了京城。虽然严嵩父子对他恨之入骨，但也有一些正直的大臣对他十分赞赏。不久后，海瑞被调任为应天巡抚。
应天地区，是明朝最富庶的地区之一，同时也是官场腐败最为严重的地方。这里有大量的豪强大户，他们与官府勾结，肆意欺压百姓。土地兼并现象极为严重，许多农民失去了土地，沦为流民。
海瑞到任后，没有丝毫的懈怠。他深知土地问题是应天的根本问题，于是决定重新丈量土地。这一决定如同在平静的湖面投下了一颗巨石，立刻引起了轩然大波。那些豪强大户们纷纷反对，他们通过各种关系向海瑞施压。
徐阶，曾经的内阁首辅，他在应天拥有大量的田地。他的家族子弟在当地横行霸道，鱼肉百姓。当他得知海瑞要重新丈量土地时，他先是写了一封信给海瑞，信中以长辈的口吻劝说海瑞不要轻举妄动，说这是应天多年的积习，难以改变，而且涉及到众多权贵的利益，弄不好会给自己招来大祸。
海瑞看了信后，并没有改变自己的想法。他亲自登门拜访徐阶。见到徐阶后，海瑞恭敬地行了礼，然后说道：“徐阁老，您曾是朝廷重臣，理应为百姓做表率。如今应天的土地兼并严重，百姓苦不堪言，若不重新丈量土地，公平赋税，这应天将永无宁日。”徐阶皱着眉头说：“海大人，你的想法是好的，但这其中牵扯太多，不是你想象的那么简单。”海瑞坚定地说：“徐阁老，我知道困难重重，但我海瑞既然身为应天巡抚，就不能眼睁睁看着百姓受苦难而不管。我希望徐阁老能够支持我的决定，将多余的田地退还给百姓。”徐阶听了这话，心中十分不悦，他觉得海瑞太不懂官场规矩了。
在海瑞的坚持下，土地丈量工作开始了。海瑞亲自监督，他要求手下的官员必须公正、严谨。那些试图在丈量过程中作弊的官员，都被海瑞严厉惩处。然而，豪强大户们并没有就此罢休。他们暗中组织人手，对海瑞进行污蔑和陷害。