就在大蛇丸沉寂一段时间之后，晓组织名声鹊起，大蛇丸想要了解这个组织的消息，就派了药师兜去当了间谍
当确认轮回眼真实存在的那一刻，大蛇丸眼中燃烧的疯狂几乎实质化。
大蛇丸突袭了晓组织据点，却在佩恩六道的压倒性力量下铩羽而归。
换作他人或许早已退避三舍，但对这位痴迷于禁忌的大蛇丸而言，失败不过是另一种开始。
此后，他像附骨之疽般纠缠不休，晓组织走到哪里，他阴鸷的身影就出现在哪里。
别的忍者是因恐惧晓组织的实力而被迫加入，唯有大蛇丸，凭借着厚颜无耻的劲头和令人头疼的韧性，在佩恩的忍耐底线边缘疯狂试探。
最终，佩恩为了避免他在外面捅出更大的篓子，只能捏着鼻子将这条危险的毒蛇纳入麾下。
与其让他在外搞事情，还不如放在眼皮底下看着
昏暗的房间里，气氛压抑得让人喘不过气来。
佩恩面无表情却难掩眼底的无奈，而屏幕另一侧的多弗朗明哥目睹这一幕，竟没来由地心头一酸。
多弗朗明哥轻轻抹了抹眼角，似真似假地挤出一滴同情的泪水
他懂啊他懂啊，这种被迫合作的憋屈感，原来他不是第一个么，不过还好他有魅力，不至于被大蛇丸用完就丢
这个佩恩绝对是被丢的那个
在晓组织的阴影庇护下，大蛇丸如同蛰伏的毒蛇，悄无声息地蚕食着组织的资源。
实验室里终日回荡着诡异的呢喃与器械碰撞声，那些从晓组织获取的珍稀药材、禁术卷轴，都成了他禁忌研究的养分。
短短数年间，他不仅将秽土转生之术的瑕疵尽数填补，更让不尸转生的秘术达到前所未有的完善境界。
而恰在此时，宇智波鼬叛逃来到了晓组织，这可真是瞌睡遇到了枕头，他刚开发完不尸转生之术，完美的身体就来了
他望着鼬的脸，眼中贪婪的欲望几乎要破体而出——那双写轮眼，那具流淌着宇智波血脉的躯体，在他眼中已然成了最诱人的猎物。
原以为一切尽在掌握，不出意外，就又出意外了。
在那与宇智波鼬短暂的交锋中，大蛇丸毫无还手之力，于瞬息之间被对方在特定环境里彻底压制，落得个仓皇逃窜的狼狈下场。
碍于晓组织严禁成员内斗的铁律，大蛇丸再度沦为组织的追杀目标。
彼时已四十五岁的大蛇丸，无奈之下重操旧业，踏上了找孩子，拐孩童的漫漫长路。
历经一番苦心经营，他终于建立起属于自己的势力——音忍村。
岁月的磨砺非但未让他收敛心性，反而令其愈发偏激偏执。
在筛选部下时，他效仿根部那套残酷至极的手段，将数十人囚禁于暗无天日的牢房，逼迫他们自相残杀，唯有侥幸存活者，方有机会获得他的青睐与重用。
尽管手段残忍，但这般近乎残酷的筛选与培育模式却收效显着。
在大蛇丸的操控下，麾下忍者的实力突飞猛进，配合他潜心开发的咒印之力，音忍村的势力也迅速壮大。
随着时间推移，大蛇丸的阵营中汇聚了诸多得力干将：
拥有晶遁血继限界的红莲，实力超群且忠诚不二；