在之前的战争中，不管是GDI还是NOD亦或者第三方势力都很理智的没有打核武器的主意。这种东西要是拿出来打上一发，那人类文明恐怕马上就要迎来一轮核冬天了。
不过很明显，在被逼急了的情况下，NOD是有用核武器鱼死网破的可能的……而且不排除这里还是一处洲际导弹发射基地的可能，NOD搞不好可以从这里朝着世界各地发射装载有核弹头的洲际弹道导弹。
在这样的情况下，怎么处理NOD的中央指挥部就成了一个棘手的问题：首先萨拉热窝地区不在GDI的控制下，甚至都不靠近GDI的控制区。虽然可以从海上发起两栖登陆，但是在这样的情况下GDI部队想要站稳脚跟然后向着大神宫的方向突破可不容易，因为他们得不到足够的支援——最近的空军基地远在千里之外，空军想要前来支援必须长途奔袭还得绕过NOD的防空阵地才行、海军的话很不凑巧前几天美国第六舰队的旗舰艾森豪威尔号（我实在找不到旗舰的有关情报，就随便写了一艘）遇袭受损，为了航母的安全考虑，第六舰队司令下令让这艘GDI方此时此刻在地中海区域唯一的航空母舰撤出地中海区域，而半数第六舰队的舰只也伴随着航空母舰一起行动，这个点应该刚刚通过直布罗陀海峡，调头回来也需要一段令人窒息的时间，而除去第六舰队这个“地中海宪兵“之外，GDI在地中海的其它海军力量都是小鱼小虾......然后这次行动也必须要快，不能给NOD发射核武器的时机、而且不止是行动速度要快，行动开始时间也要尽可能早。因为那名间谍已经暴露了，NOD肯定知道了GDI已经得知了这里情况的信息，如果再拖下去的话没人能保证不会有什么新的变数产生。
一次事关重大的任务、一次准备不充足的任务、一次敌我双方力量对比悬殊的任务、一次注定艰难的任务......在这样的情况下，最早在爱沙尼亚地区初露锋芒的那位指挥官和他麾下折兵损将的部队站了出来，成为了第一批发起进攻的GDI部队。虽然他们的状况很糟糕，但是他们依然在NOD的防线上撕开了一道口子，并且在NOD做出反应之前杀到了导弹基地里，然后破坏了那里的一切设备。但在完成这一壮举之后，这支折损严重的部队也无力继续推进到大神宫了，哪怕已经有几支零散的GDI部队通过他们建立的登陆场平安的进入了这片区域帮助他们填补战线，他们也无法继续推进了。他们只能在一定距离上对大神宫呈半包围状态，然后设立防御阵地以期援军能够尽快抵达。
然后，离子炮开火了。
在确认了凯恩本人还没有离开大神宫之后，GDI高层做出了使用依然处在实验性阶段的离子炮炸平大神宫的决定。虽然很疑惑为什么凯恩不逃，但现在不是思考这个问题的时候，而是应该趁人没走要人命的时间。凯恩是整个NOD的领袖，要是没了他，虽然不至于说NOD会一触即溃，但是他们内部的矛盾会极大的激化，而他们的内斗也无疑会极大的缓解GDI和各国所面临的压力。
而这个时候，其实GDI也拿不准离子炮的威力到底如何，（甚至精准度都不一定有保证）就像人类第一次试爆核武器的时候一样，当时大家都不确定这么小的一个玩意的杀伤力究竟能有多大，而现在GDI也拿不准这个天基武器的威力如何，但是这已经是眼下最好的选择了。