联盟在大战后的重建工作有条不紊地推进着。繁华的星际都市中，建筑机器人忙碌地修复着受损的高楼大厦，崭新的防御工事在星球表面逐渐成型；科研园区内，科学家们依据从神秘芯片中获取的前沿科技，废寝忘食地研发新一代武器与装备，量子引擎的性能被优化到新高度，能源转化效率大幅提升；军事基地里，新兵们在模拟战场中刻苦训练，喊杀声此起彼伏，他们眼神坚毅，誓要守护联盟的每一寸疆土。
吴冠每日穿梭于各个关键部门，监督工程进度、审阅科研成果、指导军事训练，忙碌却又充满希望。思梨也没闲着，她牵头组织了一场浩大的心理重建活动，为那些经历战火创伤的战士和平民提供心理疏导，帮助他们驱散阴霾，重拾生活的信心。
然而，平静的湖面下，暗流依旧涌动。情报部门在一次深入的星系巡查中，捕捉到了一些微弱却异常的能量波动。这些波动的频率与神秘敌人——“暗影议会”曾经使用过的极为相似，但又有所不同，仿佛是某种全新的实验性武器在调试。里昂立刻警觉起来，增派人手，沿着波动的源头逆向追踪。
数周后，追踪小队有了惊人发现。在一个偏远荒芜的小行星带深处，隐藏着几艘造型怪异的飞船。它们通体漆黑，表面布满了不规则的突起，如同蛰伏在黑暗中的巨兽，散发着令人不安的气息。飞船周围环绕着一层若有若无的能量场，不仅屏蔽了大部分探测信号，还干扰着周边的引力环境，导致小行星带中的碎石呈现出诡异的漂浮状态。
通过远距离的精密探测，情报人员发现这些飞船内部构造复杂，似乎搭载了前所未有的高科技装置。更令人揪心的是，一些疑似生物实验舱的区域里，影影绰绰能看到身形扭曲的实验体，痛苦地挣扎着，时不时发出无声的嘶吼，画面惊悚至极。
吴冠得知这一情况后，脸色凝重。他深知，这极有可能是“暗影议会”卷土重来的前奏，或者是某个受其蛊惑、效仿其行事风格的新兴势力崛起的迹象。“绝不能让他们羽翼丰满，必须尽早采取行动。”吴冠握紧拳头，对身边的参谋们说道。