艾文当机立断，率领小队朝着旗舰冲去。在接近旗舰的过程中，他们遭遇了重重阻碍。旗舰周围部署了强力的电磁干扰场，探索舰的导航系统失灵，护盾也在持续攻击下摇摇欲坠。但艾文没有退缩，他弹奏起灵音玉佩，以灵契之力稳定舰身，强行突破干扰场。
登上旗舰后，他们遭遇了一群凶悍的黑暗护卫。这些护卫身形高大，全身包裹在黑色铠甲中，双眼闪烁着红光，手持利刃，招式凌厉。艾文三人背靠背，与护卫们展开殊死搏斗。艾文的灵音玉佩光芒大放，音波化作无形利刃，切割着护卫的铠甲；莉亚身姿矫健，穿梭在敌阵中，以光矢攻击护卫的要害；汤姆则利用自制的能量装置，释放出脉冲波，干扰护卫的行动。
一番苦战之后，他们终于杀到了旗舰的指挥舱。舱门缓缓打开，一股浓烈的黑暗气息扑面而来。在指挥椅上，坐着一个全身笼罩在黑袍中的神秘身影，看不清面容，唯有一双散发着幽绿光芒的眼睛，透露出无尽的寒意与狡诈。
“你们以为能阻止我？太天真了。这一切不过是个开始，宇宙终将再度陷入黑暗。”神秘身影发出低沉沙哑的声音，抬手一挥，一道道黑暗能量鞭朝着艾文等人抽来。艾文迅速反应，用灵音玉佩筑起防御光幕，抵挡攻击。他知道，眼前这个神秘人，就是他们一直在寻找的黑暗主谋，必须尽快将其制服。
第四章：真相渐明
在防御光幕的保护下，艾文试图与神秘人对话，探寻其目的。“你究竟是谁？为何要破坏宇宙的安宁？”艾文高声问道。神秘人发出一阵狂笑：“我是谁？我是被你们这些灵契者遗忘的复仇者！曾经，我的族人在混沌之战中无辜受难，被当作牺牲品，而你们却在荣耀中享受和平，今日便是复仇之时！”
艾文心中一惊，他意识到，这场危机或许源于往昔战争的遗留仇恨。但他深知，无论如何，不能让无辜生灵再次陷入苦难。“过去的悲剧不能成为你如今作恶的借口，我们可以一起寻找和平解决的办法，而非让仇恨延续。”艾文诚恳说道。
然而，神秘人根本不听劝阻，攻势愈发猛烈。艾文无奈之下，只得全力迎战。在激烈交锋中，他发现神秘人黑袍下隐藏着一块散发着诡异光芒的黑暗核心，所有黑暗力量皆源于此。他瞅准时机，弹奏灵音玉佩，凝聚最强音波，朝着黑暗核心射去。
音波命中瞬间，黑暗核心剧烈颤抖，神秘人发出痛苦咆哮，身体踉跄。艾文等人趁机冲上前，欲将其制服。但就在这时，神秘人却按下了手中的一个控制器，旗舰自毁程序启动，倒计时开始。