原本五千多人的倭寇队伍，最终只有 2000 人成功登船，还有两千多人未能登船，留在了岛屿上。这些倭寇见无法上船，便凭借对地形的熟悉，在岛屿各处躲藏起来。
登船后的倭寇迅速驶出港口，分散开来，朝着明军两侧进发。他们的船只很多是从大明商人那里抢来的，由于大明允许船只买卖，其中甚至有几艘福船。一时间，倭寇船队颇具声势。
面对迎上来的倭寇，方鸣谦指挥若定，冷静地发出一道道指令，各舰紧密配合，炮火持续朝着倭寇船只倾泻。当双方船只相距大约有百米时，方鸣谦果断下令：“火绳枪，射击！”
火绳枪的子弹如密雨般射出，其密度远超火炮，射速也十分可观。两名士兵熟练地交替装药射击，保持着持续的火力输出。尽管夜色深沉，难以看清倭寇的具体位置，但凭借着密集的子弹和较高的射速，不少倭寇被击中，鲜血染红了甲板，尸体纷纷坠入大海。
佐藤尾苟从未见过火绳枪这种新式火器，看到周围的武士接连倒下，而明军的火力丝毫没有减弱的迹象，深知继续战斗下去只会造成更大的伤亡，于是果断下令撤退。
见倭寇要逃，方鸣谦并未急于追赶，而是指挥船队跟在倭寇后方五里左右。由于明军的炮火攻击，倭寇船只多处起火，在凌晨漆黑的海面上，燃烧的明火如同一座座明亮的灯塔，为明军指明了追击的方向。待倭寇将火扑灭，天边已泛起了鱼肚白。
东岸这边，周德兴面对倭寇逃跑的情况，采取了不同的应对策略。他没有选择追击，而是对着周围的将士下令：
“岛上肯定还有不少残余倭寇。传我命令，各舰两刻钟之后，步兵先行登陆，火铳兵在船上提供掩护。待岸边安全后，火铳兵再登岸。上岸后，各队密切配合，抓捕残余倭寇。记住，尽量留活口，大帅说了，这些俘虏有大用！”
在墨色的海面之上，方鸣谦率领的舰队如影随形，始终与佐藤尾苟的倭寇船队保持着恰到好处的距离。这让佐藤尾苟如坐针毡，焦虑万分。
海风裹挟着浓重的咸腥味，吹过他扭曲的面庞，佐藤尾苟咬了咬牙，眼中闪过一丝决绝，对着身旁的武士嘶吼道：“明军实力远超我们，如今已无路可退，唯有拼死一搏！”