经过这场大战，各维度之间的联系更加紧密，一个以“共生法则”为基础的多元宇宙联盟正式成立。陈默和秦轩成为了联盟的核心领导者，他们继续探索宇宙的奥秘，守护着多元宇宙的和平与安宁，而奇书的秘密，也成为了宇宙中所有生命共同守护的智慧宝藏 。
多元宇宙联盟成立后，陈默与秦轩本以为能迎来长久的和平，可新的问题接踵而至。随着联盟的发展，资源分配不均的矛盾逐渐凸显。科技发达的维度对资源需求巨大，而自然维度的资源产出有限，双方时常为此产生摩擦。
更棘手的是，暗影教徒虽被击退，但残党隐匿在各个维度的暗处，暗中破坏联盟设施，制造混乱。他们蛊惑部分弱小维度，传播对联盟的不满，导致一些维度对联盟的信任产生动摇。
陈默与秦轩为稳定联盟四处奔走。陈默穿梭在各维度间调解矛盾，用“共生法则”说服各方，引导他们建立公平的资源分配机制；秦轩则带领联盟的精锐部队，追踪暗影教徒的踪迹，打击他们的破坏行动。