柯南和灰原哀跟随毛利小五郎受邀来到了泰国，原来一位在当地颇有名望的富商遇到了棘手的事情。富商的儿子突然变得行为怪异，时而疯癫时而昏迷，当地的医生都束手无策，而民间则传言他是中了邪术降头。
富商听闻毛利小五郎的大名，便希望他能来调查此事，看是否有人暗中加害自己的儿子。柯南和灰原哀一到泰国，就感受到了这里独特的文化氛围，但也察觉到了案件背后的诡异气息。
他们来到富商家中，见到了被邪术困扰的年轻人。他面色苍白，眼神呆滞，嘴里还不时念叨着一些奇怪的话。灰原哀仔细观察了年轻人的症状，心中隐隐觉得这可能并非真正的邪术，而是某种药物或者心理作用导致的。
柯南则开始在富商家中展开调查，他发现年轻人房间的窗户上有一些奇怪的粉末，经过检测，这些粉末含有一些特殊的草药成分，可能与降头术中使用的材料有关。
在调查过程中，柯南和灰原哀还了解到富商在生意上有一些竞争对手，其中一位最近与他发生了激烈的冲突，很有可能有作案动机。
他们决定从这个竞争对手入手，经过一番周折，找到了一个与降头术有关的神秘组织。这个组织隐藏在一个偏僻的村落里，周围布满了各种奇怪的符号和陷阱。
柯南和灰原哀小心翼翼地潜入组织，发现了一些关于降头术的书籍和工具，以及一些记录着受害者信息的文件。原来，这个组织是受富商的竞争对手雇佣，利用人们对邪术的恐惧来制造恐慌，以达到打击富商的目的。